Nature Genetics :高栋/陈北山等首次识别出癌的潜在细胞起源

2022-02-21 12:19 来源:福州妇科医院

拔蛋白质/祖蛋白质的核对和角质层蛋白质论及层面的总括对于理解肺癌的时有发生至关重要。

2020年8月17日,里面国科学院上海生化蛋白质所高栋,姚洛南及斯隆-丹尼尔珍纪念碑肺前列腺癌里面心Chen Yu共同通讯在Nature Genetics 在线发表题为“Single-cell transcriptomics identifies a distinct luminal progenitor cell type in distal prostate invagination tips”的数据分析论文,该数据分析总括了来自动物仿真的35129个蛋白质,并核对了以Tacstd2,Ck4和Psca解读为标志的独特的鼻音蛋白质种类(称作C型鼻音蛋白质,Luminal-C)。位于近端内陷尖端(称作Dist-Luminal-C)的Luminal-C蛋白质表现造出更大的体外类器官转变成能力和肝蛋白质角质层导管再造能力。Luminal-C蛋白质的论及指出,Dist-Luminal-C蛋白质通过自我修正和分化修葺了近端内鼻音论及。Dist-Luminal-C蛋白质里面Pten的其会造成了角质层内瘤变。

该数据分析进一步总括了11374个人的蛋白质,并证实了h-Luminal-C蛋白质的假定。该数据分析提供了对论及层面的立论,将Dist-Luminal-C蛋白质核对为鼻音祖蛋白质为数众多,并提造出了肺癌的潜在蛋白质源于之一。

角质层由鼻音蛋白质,大块蛋白质和神经内分泌蛋白质组成。尽管已经美联社了里面假定大块拔蛋白质和管鼻音拔蛋白质,但是它们的核对仍然难以捉摸,并且角质层蛋白质论及仍然假定不清。

用到来自剥离蛋白质的功用再造测定法,先前的数据分析指出,一些大块蛋白质可以导致所有三种角质层蛋白质论及。已经有,发现大块蛋白质和鼻音蛋白质均需导致含有大块蛋白质和鼻音蛋白质论及的类器官。从剥离并置于人工必须下的大块蛋白质和鼻音蛋白质兼具转分化的能力。肝蛋白质论及实验指出,成年动物仿真的大块蛋白质和鼻音蛋白质都在更大程度上独立地自我维系,并且在早产受精每一次里面核对造出了多能和单能祖蛋白质。然而,两项独立数据分析指出,罕有的大块蛋白质兼具在肝蛋白质再造每一次里面导致鼻音蛋白质的能力。

在类器官培养必须下,近端周边地区的Sca-1 + / Nkx3.1-鼻音蛋白质被核对为双能鼻音祖蛋白质。在原始的近端周边地区是否假定兼具拔蛋白质/祖蛋白质功用的鼻音蛋白质的不同亚类仍是确实的。值得注意的是,都已相符解读在生理反应必须下充作鼻音拔/祖蛋白质的假定的多种类型的蛋白质种类。

肺癌是亚太地区最类似的肺前列腺癌之一,也是欧美国家女性与肺前列腺癌相关的失踪的第二大主要原因。尽管大多数生物原发性肺癌兼具管鼻音性状,但是在仿真管理系统里面,大块蛋白质和管鼻音蛋白质均需作为肺癌的蛋白质源于。然而,都已相符所假定的角质层蛋白质的拔蛋白质样可塑性和生理反应必须下肺癌的蛋白质源于。已经有,大块和管鼻音蛋白质为数众多均结果显示造出自我维系作用,并且两种蛋白质种类均需引致肺癌。然而,大块蛋白质的致肺癌转换成需要大块到鼻音蛋白质的转变。此外,在某些意味著,鼻音内蛋白质结果显示造出被选为肺癌源于蛋白质的趋势更大。这些数据分析特别强调了识别鼻音拔/祖蛋白质并总括其在各种意味著的行为的需要。

单个蛋白质的特称特征可提供对角质层蛋白质论及层面的基本了解,并指引潜在的拔/祖蛋白质种类。已经有,新兴的单蛋白质RNA测序(scRNA-seq)技术已准许在单个实验里面键入数以万计个单个蛋白质里面的基因解读。

在该数据分析里面通过scRNA-seq顺利地分析了35,129个成年动物仿真蛋白质和11,374个人蛋白质。通过这种强大的方法,该数据分析假定了鼻音总蛋白质数量,并相符了在二阶和再造每一次里面兼具鼻音拔/祖蛋白质功用的候选为数众多体。此外,该数据分析示范了这些蛋白质作为肺癌都是在蛋白质源于的前瞻性。

原始造原文:

Wangxin Guo, Lin Li, Juan He, et al.Single-cell transcriptomics identifies a distinct luminal progenitor cell type in distal prostate invagination tips.Nature Genetics.Published: 17 August 2020

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